Guna memperlancar transaksi bagi para pengguna jalan tol yang menggunakan e-toll card, Jasa Marga akan mengoperasikan 2 (dua) Gardu Tol Otomatis (GTO) yaitu gardu tol khusus untuk pembayaran dengan e-toll card dan khusus untuk golongan I non bis, yang dioperasikan tanpa orang pada tanggal 19 Oktober 2009,.

Pengoperasian GTO ini akan mempercepat transaksi di gerbang tol, dimana pengguna jalan tol hanya tinggal menyentuhkan e-toll card pada terminal yang disediakan tanpa harus berinteraksi dengan pengumpul tol. Dengan demikian waktu yang diperlukan untuk transaksi menjadi lebih cepat. Untuk keterangan lebih lanjut mengenai cara penggunaan e-toll card di GTO dapat dilihat pada starter pack yang disertakan pada penjualan e-toll card.

Secara teknis saat ini peralatan yang digunakan di GTO dirancang untuk transaksi kendaraan golongan I non bus, namun dalam kurun waktu ke depan, GTO dapat digunakan untuk transaksi semua golongan kendaraan. Selain itu pengguna e-toll card masih dapat bertransaksi di gardu lain.

Pengoperasian GTO ini direncanakan juga akan diterapkan di Jalan Tol Sedyatmo pada bulan November 2009, masing-masing 2 (dua) GTO  di Gerbang Tol Kapuk dan 2 (dua) di Gerbang TOl Cengkareng

Diharapkan dengan dioperasikannya GTO ini dapat membangun paradigma positif pada masyarakat tentang penggunaan e-toll card sebagai alat transaksi tol yang efektif dan efisien. Sejalan dengan pengoperasian GTO, Jasa Marga bekerja sama dengan PT Bank Mandiri sebagai penyedia e-toll card membuka gerai penjualan e-toll card di Sekitar Gerbang Tol Cililitan.

e-Toll Card
Semenjak diresmikan pengoperasiannya pada Januari 2009 lalu, e-toll card menjadi simbol gaya hidup masyarakat modern. Penggunaan e-toll card yang praktis, mudah serta cepat akan memberikan nilai tambah dalam pelayanan perusahaan kepada masyarakat. E-toll card kedepan dirancang untuk dapat dipergunakan untuk melakukan transasksi diberbagai fasilitas lainnya seperti pompa bensin, rest area dan lain-lain.

Untuk ruas tol yang dikelola Jasa Marga, saat ini E-toll card sudah dioperasikan di ruas Jalan Tol Dalam Kota Jakarta, dan Jalan Tol Sedyatmo, dan direncanakan akan segera diterapkan di beberapa ruas jalan tol lainnya seperti Padalarang-Cileunyi.